できません。 
利用者ID単位でいずれかのワンタイムパスワード機器の選択となります。
例えば、サービス管理責任者は「ワンタイムパスワードカード」に、他の利用者は「スマートフォン」に設定するなど、同一契約者番号で複数利用者が存在する場合でも、利用者ごとに異なるワンタイムパスワード機器の設定が可能です。